Озеро Манжерокское находится в двух километрах от Чуйского тракта на правом берегу Катуни у подножия гор Синюха и Малая Синюха. Если ехать по тракту на юг, то возле села Манжерок нужно свернуть налево на идущую в гору дорогу к селу Озерное. Из села влево выходит дорога, идущая вдоль озера.
В этом месте узкая долина реки Катунь расширяется на несколько километров к востоку, образуя плато, на котором и расположено озеро. Уровень воды озера превышает уровень воды в Катуни в районе поселка Манжерок на 88 метров. Озеро слабопроточное, летом верхние слои воды прогреваются до 20-24 градусов. Вода в озере содержит минералы и микроэлементы, имеет привкус и запах, но вполне пригодна для питья и даже обладает лечебными свойствами.
Чтобы увидеть озеро с высоты, нужно подняться на гору Малая Синюха на подъемнике.
В районе озера расположено несколько туристических баз. Сюда организуются экскурсии со многих турбаз, расположенных вдоль Чуйского тракта.
В 1996 году Манжерокскому озеру официально присвоен статус Памятника Природы. Из наиболее экзотических растений в Манжерокском озере сохранился занесенный в Красную Книгу водяной орех Рогульник (Чилим), который плавает в период цветения на поверхности и погружается на дно по мере созревания. Чилим иногда называют чертовым орехом, его форма похожа на голову черного рогатого чертика.
Можно сказать, что вокруг озера сформировался своеобразный оазис с уникальными мягкими природными условиями. Вокруг озера гнездится множество видов птиц, некоторые из которых занесены в Красную Книгу. В озере много рыбы, в основном караси, линь и окунь, но есть также карпы и щуки. Местные жители говорят, что рыбалка здесь круглый год.
Озеро сильно выделяется среди всех водоемов Горного Алтая своим разнообразием водной растительности, которой тут встречается больше 20 видов. В июле большие участки поверхности озера покрыты цветущими белыми лилиями. Знаменито озеро орехом Чилим. Ядро ореха содержит много крахмала и вполне съедобно. Когда-то он был довольно распространенным растением, и его использовали в различных видах для приготовления пищи, а также в лечебных целях. Сейчас такой орех в изобилии растет на озеро Саввушкино (Колыванском) в Алтайском крае.
Склоны гор с восточной и юго-восточной стороны озера покрыты живописным лесом. Деревья и кустарники спускаются до самой воды. Основная часть берегов озера заболочена, удобные подходы к воде есть только на северозападном берегу, где проходит дорога. Манжерокское озеро является популярным объектом туризма и отдыха.